Инструменты пользователя

Инструменты сайта


Боковая панель

Навигация

unix
notes
firmware
windows
Говнокод

Внешние ссылки

Внешняя ссылка

converterdicom

Это старая версия документа!


====== Меняем кодировку в DICOM и конвертируем кириллицу в латиницу. Есть у нас рентген аппарат у которого в xml файле написана кодировка ISO-8859-5, а русские символы в Windows-1251. Изменим тег с кодировкой и конвертируем кириkлицу в латиницу с помощью python и отправим это все дело в ORTHANC.

ОСТОРОЖНО ! ГОВНОКОД !

INI
# -*- coding: utf-8 -*-
import glob
import subprocess
import os
import signal
import fileinput
import sys
import time
import transliterate - [[https://gist.github.com/ledovsky/6398962|  это возьмем тут]]
reload(sys)
sys.setdefaultencoding('utf-8')

path="/mnt/data/raid1/sendDCM/"

for filepath in glob.iglob(path+'*.[dD][cC][mM]'):

    a=filepath
    b=a.split('/')[5]

    c=subprocess.Popen("dcm2xml +M +Wb " + filepath + " "+ path  + b + ".xml", shell=True)
    c.communicate()

    def replaceAll(file,searchExp,replaceExp):
        for line in fileinput.input(file, inplace=1):
            if searchExp in line:
                line = line.replace(searchExp,replaceExp)
            sys.stdout.write(line)

    replaceAll(filepath + ".xml","ISO-8859-5","WINDOWS-1251")

    fullpathxml = path + b +'.xml'

    import xml.etree.ElementTree as ET
    tree = ET.parse(fullpathxml)

    PatientName=tree.findall('data-set/element[@name="PatientName"]')[0].text
    BodyPE=tree.findall('data-set/element[@name="BodyPartExamined"]')[0].text
    if BodyPE:
        BodyPE=BodyPE
    else:
        BodyPE="Не заполнено"

    ViewPos=tree.findall('data-set/element[@name="ViewPosition"]')[0].text
    if ViewPos:
        ViewPos=ViewPos
    else:
        ViewPos="Не заполнено"

    PatientNameTrans= transliterate.transliterate(PatientName)
    BodyPETrans= transliterate.transliterate(BodyPE)
    ViewPosTrans= transliterate.transliterate(ViewPos)

    PatientNameClean=tree.findall('data-set/element[@name="PatientName"]')[0].text = PatientNameTrans
    BodyPEClean=tree.findall('data-set/element[@name="BodyPartExamined"]')[0].text = BodyPETrans
    ViewPosClean=tree.findall('data-set/element[@name="ViewPosition"]')[0].text = ViewPosTrans

    tree.write(fullpathxml)

    d=subprocess.Popen("xml2dcm -f "+path + b + ".xml "+ path + b +".mod", shell=True)
    time.sleep(5)
    e=subprocess.Popen("dcmsend -nuc +ma orthanc.medcorp.local 4242 "+ path + b +".mod", shell=True)
    time.sleep(5)
    e.communicate()
    os.remove(filepath)
    for xmlpath in glob.iglob(os.path.join(path, '*.xml')):
        os.remove(xmlpath)
    for modpath in glob.iglob(os.path.join(path, '*.mod')):

converterdicom.1619497440.txt.gz · Последнее изменение: 2021/04/27 04:24 — sector

Яндекс.Метрика