Различия

Показаны различия между двумя версиями страницы.

--- orthanc [2019/04/12 07:31]
sector создано
+++ orthanc [2022/05/27 02:34] (текущий)
sector
@@ Строка 1: / Строка 1: @@
-Раньше ничем таким не занимался, знания о DICOM заканчиваются на том, что это формат медицинских изображений…
+Раньше ничем таким не занимался, знания о DICOM заканчиваются на том, что это формат медицинских изображений…\\
-На работе есть несколько медицинских устройств, которые обмениваются снимками с компа оператора на комп врача.
+На работе есть несколько медицинских устройств, которые обмениваются снимками с компа оператора на комп врача.\\
-На каждом оборудовании есть своя программа и на станциях врачей своя.
+На каждом оборудовании есть своя программа и на станциях врачей своя.\\
-Решил попробовать сделать единое хранилище.
+Решил попробовать сделать единое хранилище. \\
-Конечно, можно купить и платные продукты, но это не наш метод.
+Конечно, можно купить и платные продукты, но это не наш метод.\\
-Поиск выдал Orthanc, система у меня Debian 9, так что решил поставить из репозитория:
+Поиск выдал Orthanc, система у меня Debian 10, так что решил поставить из репозитория:\\
 <code | ini>
@@ Строка 12: / Строка 12: @@
 </code>
-Установился, поправил конфиг для того что бы зайти в WEB, загрузил несколько картинок, по игрался...
+Установил, поправил конфиг для того что бы зайти в WEB, загрузил несколько картинок... \\
-Но что-то мне не совсем понравился стандартный web viewer...
-Решил прикрутить  вьювер от Osimis.
-Прописал в конфиг плагин:
-<code | ini >
+В последних версиях пользователи хранятся тут :
-"Plugins" : [
+<code | ini>
+credentials.json
+{
+  /**
+   * Sensitive configuration options. This file must *not* be
+   * publicly-readable. It must only be readable by the users that run
+   * the "orthanc" service.
+   **/
+  // The list of the registered users. Because Orthanc uses HTTP
+  // Basic Authentication, the passwords are stored as plain text.
+  "RegisteredUsers" : {
+    "alice" : "alicePassword"
+    "admin" : "adminPassword",
+  }
+}
+</code>
+Включение http сервера и авторизации тут:
+<code | ini>
+Orthanc.json
+ "HttpServerEnabled" : true,
+ "AuthenticationEnabled" : true,
+</code>
+Что-то мне не понравился стандартный web viewer...\\
+Решил прикрутить  viewer от Osimis.  \\
+скачиваем:
+<code | ini>
+wget http://orthanc.osimis.io/lsb/plugin-osimis-webviewer/releases/1.2.0/libOsimisWebViewer.so
+</code>
+нужно посмотреть -> http://orthanc.osimis.io/lsb/plugin-osimis-webviewer/releases/1.3.1/libOsimisWebViewer.so
+по умолчанию подгружаются все плагины находящиеся в папке /usr/share/orthanc/plugins\\
+поэтому директиву Plugins править не нужно.\\
+скаченную библиотеку надо поместить в папку: /usr/share/orthanc/plugins\\
+и перезапустить orthanc.\\
+<code | ini>
+// Whether remote hosts can connect to the HTTP server
+  "RemoteAccessAllowed" : false, -  исправить на true что бы зайти в  WEB
+  "Plugins" : [
     "/home/user/ libOsimisWebViewer.so r.so",
 ]
 </code>
-И был послан,  данный плагин поддерживается в версии 1.5.3 и выше
-Решил собирать из исходников…
+TITLE AE -сервера, собственно куда отправляются снимки
+И кодировка в которую они будут преобразованы "DefaultEncoding" : "Windows1251",
-Ставим необходимое:
 <code | ini>
-sudo apt-get install build-essential unzip cmake mercurial uuid-dev libcurl4-openssl-dev liblua5.1-0-dev  libgtest-dev libpng-dev libsqlite3-dev libssl-dev libjpeg-dev  zlib1g-dev libdcmtk-dev libboost-all-dev libwrap0-dev libcharls-dev libjsoncpp-dev libpugixml-dev doxygen
+  // The DICOM Application Entity Title
+  "DicomAet" : "ORTHANC",
+  // Check whether the called AET corresponds to the AET of Orthanc
+  // during an incoming DICOM SCU request
+  "DicomCheckCalledAet" : false,
+  // The DICOM port
+  "DicomPort" : 4242,
+  // The default encoding that is assumed for DICOM files without
+  // "SpecificCharacterSet" DICOM tag, and that is used when answering
+  // C-Find requests (including worklists). The allowed values are
+  // "Ascii", "Utf8", "Latin1", "Latin2", "Latin3", "Latin4",
+  // "Latin5", "Cyrillic", "Windows1251", "Arabic", "Greek", "Hebrew",
+  // "Thai", "Japanese", "Chinese", "JapaneseKanji", "Korean", and
+  // "SimplifiedChinese".
+  //"DefaultEncoding" : "Latin1",
+  "DefaultEncoding" : "Windows1251",
 </code>
-скачиваем^
+<code | ini>
+WEB-интерфейс тут http://ваш ip:8042/app/explorer.html
+</code>
+{{:orthanc1.jpg?400|}}
+Подключение к СУБД:
 <code | ini>
-wget  https://www.orthanc-server.com/downloads/get.php?path=/orthanc/Orthanc-1.5.6.tar.gz
+apt-get install default-mysql-server default-mysql-clietn defaultlt-libmysqlclient-dev orthanc-mysql
+</code>
+Увеличиваем размер блока данных:
+<code | ini>
+mcedit my.cnf
+max_allowed_packet = 128M
 </code>
-распаковываем, собираем:
+создаем пользователя и бд, подключаемся:
 <code | ini>
-# cmake -DALLOW_DOWNLOADS=ON \
+mcedit /etc/orthanc/mysql.json
-        -DUSE_GOOGLE_TEST_DEBIAN_PACKAGE=ON \
-        -DUSE_SYSTEM_CIVETWEB=OFF \
+cat /etc/orthanc/mysql.json
-        -DDCMTK_LIBRARIES=dcmjpls \
+{
-        -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release \
+  /**
-        ~/Orthanc-1.5.6
+   * Configuration to use MySQL or MariaDB instead of the default
-# make
+   * SQLite back-end of Orthanc. You will have to install the
-# make install
+   * "orthanc-mysql" package to take advantage of this feature.
+   **/
+  "MySQL" : {
+    // Enable the use of MySQL to store the Orthanc index?
+    "EnableIndex" : true,
+    // Enable the use of MySQL to store the DICOM files?
+    "EnableStorage" : true,
+    // Parameters of the MySLQ database
+    "Host" : "localhost",
+    "Port" : 3306,
+    "Database" : "orthanc",
+    "Username" : "orthanc",
+    "UnixSocket" : "/var/run/mysqld/mysqld.sock",
+    "Password" : "dDE4dkULEYrbBZxc",
+    // Optional: Disable the locking of the MySQL database
+    "Lock" : true
+  }
+}
 </code>
-Скачал и подкинул плагин:
+Контроль доступа и отправка на другие модальности:
+<code | ini>
+Orthanc.json
+  "LuaScripts" : [
+    "/etc/orthanc/lua/access.lua",
+    "/etc/orthanc/lua/send.lua"
+  ],
+"sample" : [ "AE_TITLE", "192.168.1.235", 4006 ]
+</code>
+Lua:
+Разрешения выполнять запросы  к Orthanc, с помощью этого скрипта можно разграничить права доступа к web интерфейсу Orthanc
 <code | ini>
-wget http://orthanc.osimis.io/lsb/plugin-osimis-webviewer/releases/1.2.0/libOsimisWebViewer.so
+cat access.lua
+function IncomingHttpRequestFilter(method, uri, ip, username, httpHeaders)
+   -- Only allow GET requests for non-admin users
+  if method == 'GET' or method == 'POST' then
+      return true
+   elseif username == 'admin' then
+      return true
+   else
+      return false
+   end
+end
 </code>
-все заработало.
-Конфиг был тут - /root/Orthanc-1.5.6/Resources/Configuration.json - собственно где распаковывал и собирал.
+Можно по ip
-Пока что в конфиге исправил только одну строчку, разрешающую доступ к Web-интерфейсу
 <code | ini>
-// Whether remote hosts can connect to the HTTP server
-  "RemoteAccessAllowed" : false, -  исправить на true что бы зайти в  WEB
+function IncomingHttpRequestFilter(method, uri, ip, username, httpHeaders)
+  if method == 'GET' and (username == 'user' or username == 'admin') then
+    -- Read-only access (only GET method is allowed)
+    return true
+  elseif username == 'admin' and ip == '127.0.0.1' then
+    -- Read-write access for administrator (any HTTP method is allowed on localhost)
+    return true
+  else
+    -- Access is disallowed by default
+    return false
+  end
+end
 </code>
-WEB-морда тут http://ваш ip:8042/app/explorer.html
-Запуск с нужным конфигом:
+С помощью этого скрипта можно отправлять снимки которые пришли в Orthanc на другие DICOM сервера или на рабочие станции врачей.
 <code | ini>
-# Orthanc /root/Orthanc-1.5.6/Resources/Configuration.json
+cat send.lua
+function OnStoredInstance(instanceId, tags, metadata)
+    SendToModality(instanceId, 'sample')
+end
 </code>
+С помощью этого скрипта можно разбирать изображение которые приходят на Orthanc и маршрутизировать их на другие сервера.
+<code | ini>
+cat /etc/orthanc/lua/send.lua
+function OnStoredInstance(instanceId, tags, metadata)
+    local Modality = tags['Modality']
+        if string.find(Modality, 'CR') ~= nil then
+            SendToModality(instanceId, 'sample')
+        elseif string.find(Modality, 'MR') ~= nil then
+            SendToModality(instanceId, 'sample')
+        end
+end
+</code>
-Будем курить дальше.
-Продолжение скоро.
-В плане подключить MariaDB и собирать все снимки с устройств централизованно.
+перезапускаем:
+<code | ini>
+services orthanc restart
+</code>
+Удаление старых записей
+<code | ini>
+ $ curl --user admin:password http://localhost:8042/tools/find -d '{"Level":"Study","Query":{"StudyDate":"20120101-20121231"}}'
+[
+   "6e2c0ec2-5d99c8ca-c1c21cee-79a09605-68391d12",
+   "ef2ce55f-9342856a-aee23907-2667e859-9f3b734d"
+]
+$ curl -X DELETE http://localhost:8042/studies/6e2c0ec2-5d99c8ca-c1c21cee-79a09605-68391d12
+$ curl -X DELETE http://localhost:8042/studies/ef2ce55f-9342856a-aee23907-2667e859-9f3b734d
+</code>

writer.logalhost.ru

Инструменты пользователя

Инструменты сайта

Различия

Инструменты страницы